A. Présentation
du programme de recherche du consortium Cerise
Notre travail s’inscrit dans le programme du
Consortium d'Etude des Réseaux d'Interactions des Systèmes
Eucaryotes
(Cerise).
Nous allons en présenter le schéma général avant de
voir plus en détail certains résultats obtenus dont nous avons
besoin pour définir le cadre de notre travail.
Cerise a pour but l’étude des
interactions génétiques et moléculaires. Il fait partie du
programme génome du CNRS. Cinq équipes de recherche venant de
disciplines différentes y prennent part. La plupart de ces équipes
font partie du CNRS et travaillent sur des thématiques de
génétique. Deux laboratoires font exception car leurs
thèmes de recherche ne sont pas traités au CNRS. Il s’agit
de l’INRIA
Rhône-Alpes [22],
spécialisé en intelligence artificielle, et du CRRM qui est
spécialisé en science de l’information et dont je fais
partie. La compagnie Xerox a participé aux opérations en
collaborant avec l’INRIA Rhône-Alpes.
La direction du consortium est assurée par
Bernard Jacq qui est chargé de recherche au
LGPD [23].
Pour mener son étude sur les interactions
génétiques et moléculaires, le consortium s’est
donné trois axes de travail :
- Saisie d’informations sur les interactions
génétiques et moléculaires
- Représentation de ces informations à
partir de base de connaissance par objet
- Exploitation de ces informations : analyse,
comparaison et simulation de
fonctionnement.
Voyons maintenant
brièvement chacun de ces axes de recherche.
[22]
Institut national de la recherche en informatique et
automatique.
[23]
Laboratoire de génétique et développement de
Marseille.
