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1. Choix de Medline
Medline est une base de données bibliographiques. Cela signifie qu’elle est conçue pour aider les chercheurs à se tenir informés des avancés scientifiques dans leur discipline. Medline recense des articles scientifiques de façon à donner accès à ces documents, le chercheur étant invité à commander le document dont il a lu un résumé dans la base de données. L’intérêt de ce type de base de données bibliographique réside pour nous dans le fait que les auteurs donnent souvent l’essentiel de leurs résultats dans le résumé. Les interactions décrites dans les articles eux-même ont donc toutes les chances de se trouver aussi dans le résumé. Par ailleurs, les articles sont souvent d’accès payant et il n’existe pas de base de données gratuite d’articles en texte intégral, tout du moins de taille comparable à Medline.
La base de données Medline à l’avantage d’être accessible gratuitement et d’être très complète. Elle compte en effet plus de neuf millions de résumés. Elle traite d’aspects très divers de la médecine et de la biologie. Cependant, même sur un aspect précis comme celui de la génétique de la drosophile, elle peut rivaliser avec les meilleures bases de données spécialisées. Nous en voulons pour preuve qu’elle est largement utilisée par les chercheurs s’intéressant à la génétique de la drosophile.
Son principal avantage pour notre travail consiste dans le fait qu’elle traite de plusieurs organismes modèles. Ainsi, la drosophile est traitée, mais aussi la souris et l’homme qui sont deux organismes modèles très intéressants pour la recherche sur les interactions génétiques ou moléculaires. Ainsi, les méthodes que nous mettons au point sur la drosophile pourront être adaptées facilement à l’analyse de données sur d’autres organismes modèles. Cela n’aurait pas été le cas s’il avait fallu changer de base de données.

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