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a. Inclusion à l’intérieur du dictionnaire des gènes
Une autre difficulté réside dans le fait que les labels s’emboîtent les uns dans les autres à la manière des poupées russes : on utilise le nom d’un gène pour construite le nom d’un autre gène. Hairless est un gène, Supressor of Hairless un autre gène, le second ayant la particularité d’inhiber l’expression du premier. Nous dirons dans ce cas que le label Hairless est inclus dans le label Supressor of Hairless.
Voici un exemple de phrase où cette inclusion pose un problème d’interprétation.
Exemple 6 Inclusion des labels
La première occurrence de Hairless (soulignée) ne doit pas être interprétée comme le gène du même nom car elle est incluse dans le label Suppressor of Hairless qui désigne un autre gène. En revanche la seconde occurrence de Hairless fait bien référence au gène Hairless (H).
These results, along with the intermediate SOP phenotype observed in Suppressor of Hairless; Hairless double mutant imaginal discs, suggest that the two genes act antagonistically to commit imaginal disc cells stably to alternative fates.
Le danger consiste à repérer à tort le label inclus sans repérer le label qui l’inclut, où ce qui est plus grave, repérer les deux labels à la fois. La solution passe nécessairement par la tenue d’une table d’inclusion qui consigne chacune d’elles de façon à pouvoir y faire référence lors du repérage des labels dans les textes. Le tableau 10 en donne un extrait.
Tableau 10 Table d’inclusion des labels
Les labels sont inclus les uns dans les autres. Le Label 1 est inclue dans le Label 2, mais ils désignent des gènes différents.
Label 1
Label 2
Gène 1
Gène 2
fu
Su(fu)
fused (fu)
Suppressor of fused (Su(fu))
H
Su(H)
Hairless (H)
Suppressor of Hairless (Su(H))
Hairless
Suppressor of Hairless
Hairless (H)
Suppressor of Hairless (Su(H))
knirps
knirps-related
knirps (kni)
knirps-like (knrl)
Pc
E(Pc)
Polycomb (Pc)
Enhancer of Polycomb (E(Pc))
P-element
P-element somatic inhibitor
P element (P-element)
P-element somatic inhibitor (Psi)
pn
K-pn
prune (pn)
abnormal wing discs (awd)
scute
lethal of scute
scute (sc)
lethal of scute (l(1)sc)
Scute
Lethal of Scute
scute (sc)
lethal of scute (l(1)sc)
scute
lethal-of- scute
scute (sc)
lethal of scute (l(1)sc)
sev
E(sev)3A
sevenless (sev)
Heat shock protein 83 (Hsp83)
sev
E(sev)3B
sevenless (sev)
(Cdc37)
sevenless
bride of sevenless
sevenless (sev)
bride of sevenless (boss)
stoned
Suppressor of stoned
stoned B (stnB)
Suppressor of stoned (Su(stn))
stoned
Suppressor of stoned
stoned A (stnA)
Suppressor of stoned (Su(stn))
tolloid
tolloid-related-1
tolloid (tld)
tolkin (tok)
tra
tra-2
transformer (tra)
transformer 2 (tra2)
transformer
transformer 2
transformer (tra)
transformer 2 (tra2)
Trithorax
Trithorax-like
torso (tor)
Trithorax-like (Trl)
white
Zeste-white 3
white (w)
shaggy (sgg)
z
E(z)
zeste (z)
Enhancer of zeste (E(z))
z
E(z)1
zeste (z)
Enhancer of zeste (E(z))
z
Su(z)2
zeste (z)
Suppressor of zeste 2 (Su(z)2)
z
Su(z)2(1)
zeste (z)
Suppressor of zeste 2 (Su(z)2)
zeste
Enhancer of zeste
zeste (z)
Enhancer of zeste (E(z))
Notons qu’il se peut que l’inclusion se fasse pour des labels utilisés pour définir le même gène. Dans l’extrait que nous avons présenté, les inclusions sont relatives à des gènes distincts. Notons que le tableau, s’il était exhaustif, compterait un peu plus de 4000 lignes.

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