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a. Choix des résumés Medline
La constitution de l’échantillon s’est faite par rapport au fichier de phrases issu de Flybase qu’a étudié Pillet. Ces phrases sont des notes prises par les annotateurs de Flybase à partir de publications pour la plupart référencées par Medline. Nous avons décidé de prendre comme échantillon les résumés Medline de ces publications. Nous avons justifié ce choix dans la section Partie 1 Chapitre 3 II.A.2. Techniquement nous avons suivi le lien qui existe entre les phrases du fichier que nous a donné Pillet et des enregistrements d’une base de données de références bibliographiques issues de Flybase. Ces références bibliographiques citent elles-mêmes des références Medline. En conjuguant les deux liens, nous obtenons un lien direct entre les données qu’a étudiées Pillet et les données que nous avons étudiées. Ce lien est représenté par une référence au résumé dans la table des phrases issues de Flybase que nous présentons dans le tableau 60.
Tableau 60 Table phrase Flybase
Ce tableau présente un enregistrement de la table.
Champ
Contenu
Clef
3597
Symbole
#su(w[a])
N° Flybase
46126
Prase
Control of su(w[a]) is controlled at the level of splicing and this control represents autorepression of su(w[a]) expression
Phrase1
CONTROL #su(w[a]) CONTROL LEVEL SPLICE CONTROL REPRESENT AUTOREPRESS #su(w[a]) EXPRESS
Phrase2
CONTROL CONTROL LEVEL SPLICE CONTROL REPRESENT AUTOREPRESS EXPRESS
Validation
Y
Direction
Y
Type
R
Interaction
su(w[a])_su(w[a])/R
Problème

N° Medline
88166655
Titre
Evidence that a regulatory gene autoregulates splicing of its transcript.
Auteurs
Zachar Z^Chou TB^Bingham PM
IVI
0,095
Les données fournies par Pillet ont été intégrées telles quelles, c’est à dire que nous n’avons pas cherché à les structurer selon une logique de base de données relationnelles. La technique d’import sera décrite dans la section b.iii.
Certaines phrases issues de Flybase citent des résumés qui sont absents de notre base de données. Il s’agit de résumés qui étaient absents de l’ensemble des résumés que nous avons extraits de Medline.
Une partie des résumés de notre base de données ne sont cités par aucune phrase Flybase. Il s’agit des résumés d’origine sans nom de gène. Nous avons présenté la table origine dans la section A.2.a.ii.2e).

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