a. Choix des
résumés Medline
La constitution de l’échantillon
s’est faite par rapport au fichier de phrases issu de Flybase
qu’a étudié Pillet. Ces phrases sont des notes prises par
les annotateurs de Flybase à partir de publications pour la
plupart référencées par Medline. Nous avons
décidé de prendre comme échantillon les
résumés Medline de ces publications. Nous avons
justifié ce choix dans la section Partie 1
Chapitre 3 II.A.2. Techniquement nous avons suivi le lien qui existe entre
les phrases du fichier que nous a donné Pillet et des enregistrements
d’une base de données de références bibliographiques
issues de Flybase. Ces références bibliographiques citent
elles-mêmes des références Medline. En conjuguant les
deux liens, nous obtenons un lien direct entre les données qu’a
étudiées Pillet et les données que nous avons
étudiées. Ce lien est représenté par une
référence au résumé dans la table des phrases
issues de Flybase que nous présentons dans le tableau 60.
Tableau 60 Table phrase
Flybase
Ce tableau présente un enregistrement de la
table.
Champ
|
Contenu
|
Clef
|
3597
|
Symbole
|
#su(w[a])
|
N° Flybase
|
46126
|
Prase
|
Control of su(w[a]) is controlled at the level of
splicing and this control represents autorepression of su(w[a])
expression
|
Phrase1
|
CONTROL #su(w[a]) CONTROL LEVEL SPLICE CONTROL
REPRESENT AUTOREPRESS #su(w[a]) EXPRESS
|
Phrase2
|
CONTROL CONTROL LEVEL SPLICE CONTROL REPRESENT
AUTOREPRESS EXPRESS
|
Validation
|
Y
|
Direction
|
Y
|
Type
|
R
|
Interaction
|
su(w[a])_su(w[a])/R
|
Problème
|
|
N° Medline
|
88166655
|
Titre
|
Evidence that a regulatory gene autoregulates
splicing of its transcript.
|
Auteurs
|
Zachar Z^Chou TB^Bingham PM
|
IVI
|
0,095
|
Les données fournies par Pillet ont
été intégrées telles quelles, c’est à
dire que nous n’avons pas cherché à les structurer selon une
logique de base de données relationnelles. La technique d’import
sera décrite dans la section b.iii.
Certaines phrases issues de Flybase citent des
résumés qui sont absents de notre base de données. Il
s’agit de résumés qui étaient absents de
l’ensemble des résumés que nous avons extraits de
Medline.
Une partie des résumés de notre base de
données ne sont cités par aucune phrase Flybase. Il
s’agit des résumés d’origine sans nom de
gène. Nous avons présenté la table origine dans
la section A.2.a.ii.2e).