b. Structure de
données pour la reconnaissance des définitions
- La table des reconnaissances des
définitions
Après avoir
reconnu les labels, ce sont les définitions de gènes qui sont
reconnues. L’information est placée dans la table reconnaissance
des définitions dont nous donnons un enregistrement dans le tableau 58. La table est intitulée RDG
pour Reconnaissance Définition de Gène.
Tableau 58 Table reconnaissance des
définitions
Le tableau donne un exemple d’enregistrement de
la table.
|
Champ
|
Contenu
|
|
Clef Reconnaissance
|
1639
|
|
N° Phrase
|
21097
|
|
Position
|
39
|
|
N°Définition
|
19078
|
|
Problème
|
|
|
Processus
|
Expert
|
|
Redondant
|
Non
|
|
Date
|
21/04/00 17:58:38
|
L’exemple que nous donnons là correspond
à la première occurrence du gène patched (pct) dans
l’exemple 4. La définition du
gène est celle qui associe le label pct au gène patched
(pct).
Le champ redondant permet de noter que la
reconnaissance du gène a déjà eu lieu avec le mot qui
précède. Ce concept est expliqué dans la section Chapitre 1 I.F.3.
La signification du champ Processus est
donnée dans la section qui suit.
- Structure de données pour savoir quel est le
processus d’indexation qui a été mis en œuvre
L’inventaire des
modalités possibles du champ processus de la table des
reconnaissances est réalisé grâce à la table
processus dont le tableau 59 donne le
contenu. La table est intitulée PRG pour Processus
Reconnaissance Gène.
Tableau 59 Table des
processus
La table donne la nature du processus qui a conduit
à la reconnaissance d’une définition de
gène.
|
Clef
|
Processus
|
Prendre
|
Auto
|
Commentaires
|
|
1
|
non renseigné
|
Non
|
Oui
|
Pas de valeur.
|
|
2
|
Expert
|
Oui
|
Non
|
Reconnaissance faite par
l'annotateur.
|
|
3
|
Définition ignorée
|
Non
|
Oui
|
La définition ne doit pas être prise en
compte dans la reconnaissance.
|
|
4
|
Reconnaissance confirmée
|
Oui
|
Oui
|
Reconnaissance confirmée. Une autre
définition du même gène est reconnue dans les
textes.
|
|
5
|
Label non confirmée
|
Non
|
Oui
|
Défault de confirmation du
label.
|
|
6
|
Définition non
confirmée
|
Non
|
Oui
|
Défault de confirmation de la
définition.
|
|
7
|
Reconnaissance multiple
isolée
|
Non
|
Oui
|
Défault de confirmation de la reconnaissance
multiple.
|
|
8
|
Reconnaissance simple
|
Oui
|
Oui
|
Reconnaissance simple non
confirmée.
|
Les processus sont généralement
automatiques (champ auto) sauf dans un processus qui est le processus
expert. Les reconnaissances sont considérées comme à
prendre (champ prendre) ou à laisser selon le processus qui leur a
donné naissance. Les processus seront expliqués dans la
partie B.3.
