c. Les variantes imprévues

Voyons le cas des définitions variantes qui ne sont pas actuellement anticipées par le système que nous proposons. Le tableau 25 répertorie celles que nous avons trouvées.

Tableau 25 Variantes imprévues

Chaque ligne du tableau donne une définition rencontrée au moins une fois dans l’échantillon A. Elles sont toutes absentes du dictionnaire issu de Flybase. Ces variantes ne sont pas actuellement prévues par le système. Elles ont été introduites manuellement par l’annotateur.

Label	Gène
abdominal- A	abdominal A (abd-A)
Absent, small or homeotic discs1	absent, small, or homeotic discs 1 (ash1)
AceIJ40	Acetylcholine esterase (Ace)
acetylcholinesterase	Acetylcholine esterase (Ace)
Acetylcholinesterases	Acetylcholine esterase (Ace)
alpha- spectrin	alpha Spectrin (alpha-Spec)
cyclin E	Cyclin E (CycE)
D- Mek	Downstream of raf1 (Dsor1)
D-mekts	Downstream of raf1 (Dsor1)
dorsal switch protein	Dorsal switch protein 1 (Dsp1)
double sex	doublesex (dsx)
EGF-Receptor	EGF receptor (Egfr)
Extra sex combs	extra sexcombs (esc)
Extramacrochaete	extra macrochaetae (emc)
extra-macrochaete	extra macrochaetae (emc)
histone H1	Histone H1 (His1)
histone H3	Histone H3 (His3)
Hsp90	Heat shock protein 83 (Hsp83)
I elements	I element (I-element)
Lethal of Scute	lethal of scute (l(1)sc)
lethal-of- scute	lethal of scute (l(1)sc)
phosrestins I	Arrestin B (Arr2)
Segregation Distorter	Segregation distorter (Sd)
Zeste-white 3	shaggy (sgg)
Zeste-White 3	shaggy (sgg)
zeste-white 3	shaggy (sgg)

Nous remarquons dans le tableau 25, que des variantes actuellement imprévues sont la conséquence de transformations systématiquement opérées, bien que non prise en charge par le système. Le système pourrait donc être amélioré pour prendre en charge ces transformations.

La présence des labels Abdominal- A, alpha- spectrin, D- Mek et lethal-of- scute s’explique par un formatage particulier des textes de Medline. Il s’agit assez vraisemblablement d’un traitement automatique effectué sur les textes qui a pour but de permettre des recherches en texte intégral sur des termes qui participent à des mots composés. Cependant cet espace après le tiret n’est pas systématique.

Nous remarquons aussi à l’œuvre des transformations de concaténation dans les labels acetylcholinesterase, Acetylcholinesterases et extramacrochaete.

Symétriquement les labels double sex et extra sex combs résultent d’une transformation de scission.

Des opérations de mise en majuscule des premières lettres de certains des mots qui entrent dans la composition d’un label sont aussi à l’œuvre dans Lethal of Scute et Segregation Distorter.